كيف تساعد أجهزة الكمبيوتر العملاقة الأقوياء أجهزة الكمبيوتر المتواضعة تصميم الأدوية الشخصية

ويقول مركز الحوسبة الفائقة في برشلونة إن الطريقة الجديدة هي إحدى الخطوات الملموسة الأولى في الطب الشخصي.

ساعد مركز برشلونة للحواسيب الفائقة في إنشاء طريقة جديدة لاختيار العلاجات المضادة للفيروسات العكوسة وتصميم العقاقير بسرعة أكبر باستخدام أجهزة الكمبيوتر المختبرية العادية.

العمل على كيفية تفاعل الجزيئات الحيوية في وحول الخلايا الحية يطالب للغاية من حيث موارد الحوسبة. هذه الجزيئات هي المسؤولة عن عمليات الصيانة والتمثيل الغذائي في الجسم.

لمعالجة مشكلة حساب الموارد هذه، أنشأ مركز برشلونة للحوسبة الفائقة (بسك) برنامجا يسمى بروتين إنيرجي لاندكيب إكسبلوراتيون، أو بيلي، لتحليل هياكل البروتين، يمكن الوصول إليها من خلال خادم الويب.

ويمكن أن يتنبأ كيف تتفاعل العقاقير مع أهدافها، وقد تبين أن لديها مزايا على البرامج المتاحة تجاريا، وفقا لممارسة سسار المعيار، التي أجرتها مجموعة من الباحثين في جامعة ميشيغان.

العمل مع إرسيكايكسا، وقد استخدمت معهد بحوث الإيدز الكاتالونية، بسك الآن بيلي لتطوير طريقة المعلوماتية الحيوية للتنبؤ بفعالية الأدوية المضادة للفيروسات العكوسة المستخدمة لعلاج فيروس نقص المناعة البشرية.

كنيسة صغيرة في قلب برشلونة ونيفيسيتي هي موطن لأحد أقوى الحواسيب الفائقة في أوروبا – وخليفة المحمول القائم على رقاقة قيد التطوير.

تجمع هذه الطريقة بين تسلسل الحمض النووي لفيروس العوز المناعي البشري وتحديد الطفرات الجينية والنمذجة البروتينية الحسابية والمحاكاة لكيفية ارتباط العقاقير مع بروتينات الفيروس.

ولكن الأهم من ذلك، يمكن أن يتم تنفيذ هذه الطريقة في أقل من 24 ساعة على معدات الحوسبة صغيرة نسبيا، مثل بيسي القياسية، وهي متاحة في أي مختبر.

حتى الآن، وقد استخدمت معلومات المريض للتنبؤ تأثير الطفرات فيروس نقص المناعة البشرية على فعالية الأدوية. العيب مع هذا النهج هو أنه لا يمكن أن تلبي الطفرات التي لا توجد سجلات.

يستخدم الأسلوب بسك-إرسيكايكسا بيلي لجعل التنبؤات على أساس خصائص كل طفرة جينية وعلى التغييرات التي تنتجها الطفرات في بروتينات الفيروس، التي تعمل كهدف للأدوية.

يقول الباحث فيكتور غوالار لموقع الويب: “يستخدم الجميع تقريبا نهجا حاسما في إجراء المحاكاة الجزيئية، وقد قررنا استخدام مقاربة عشوائية (موزعة متغيرات عشوائية) تسمى مونتي كارلو، ودمجها مع تقنيات التنبؤ بالبروتينات.

إذا كنت ترغب في جهاز كمبيوتر سريع حقا، ثم لينكس هو نظام التشغيل الخاص بك، وقد تكون إنتل الشركة المصنعة للرقائق الخاص بك.

لذلك في بضع ساعات فقط يمكننا الحصول على المعلومات التي كان يستغرقها أيام أو أسابيع للحصول عليها مع أساليب أخرى.

في هذه اللحظة، واجهة البرنامج ليست ودية للغاية، لذلك غوالار وفريقه يعملون على تحسينه. الخطوة التالية هي جلب الواقع الافتراضي إلى النظام، حتى الخبراء في جميع أنحاء العالم يمكن أن تعمل عن بعد على نفس النظام، كما يقول.

كيف تخطط ميتونبلاس لفتح الباب لشكل جديد من مبادلة المنزل؛ الشمس والبحر والمصدر المفتوح: كيف تحاول جزر البليار الإسبانية أن تتحول إلى جنة التكنولوجيا؛ تعال معي: لماذا كاتالونيا هو حقا رؤية الطائرات بدون طيار تقلع

سوسيال إنتيربريس؛ لينكيدين تكشف النقاب عن منصة جديدة للتدوين؛ تحليلات البيانات الكبيرة؛ هل هذا هو عصر أولاب كبيرة؟؛ تحليلات البيانات الكبيرة؛ يهدف داتاروبوت لأتمتة الفاكهة منخفضة شنقا من علوم البيانات؛ تحليلات البيانات الكبيرة؛ مؤسس مابر جون شرودر يتنحى، كو ليحل محل

غوالار يعتقد أن النظام المتقدمة مع بيلي هي واحدة من الخطوات النمذجة الجزيئية الملموسة الأولى في مجال ما سوف يكون في نهاية المطاف شخصية الطب.

وقال: “سيتم تحديد العلاج بعد التحليل الجيني لأسباب المرض في كل مريض [لتحديد] أي الدواء سيكون الأكثر فعالية في كل حالة على حدة”.

وبالنسبة لباحث إرسيكايكسا مارك نوغيرا ​​- جوليان، فإن النظام المتقدم هو “دليل متعدد التخصصات على مفهوم يتغلب على القيود المفروضة على الممارسة الحالية عند تحديد العلاج المضاد للفيروسات القهقرية، والذي يسمح، بالإضافة إلى ذلك، بتصميم أدوية جديدة بسرعة أكبر”.

ينكدين يكشف النقاب عن منصة جديدة للتدوين

اقرأ المزيد من مدونة إيت إيبيريا

هل هذا هو عمر أولاب الكبير؟

يهدف داتاروبوت لأتمتة الفاكهة منخفضة شنقا من علم البيانات

مؤسس مابر جون شرودر يتنحى، كو ليحل محل

Refluso Acido